新生儿测序有望辅助代谢疾病的筛查

美国医学遗传学学会（ACMG）的临床遗传学年会于3月24⑵8日在美国盐湖城举行。加州大学旧金山分校的RobertNussbaum在会议上表示，高通量的外显子组测序有望作为辅助的筛查检测，发现新生儿的代谢疾病。

4家机构最近发起了1项称为“NewbieSeq（NBSeq）”的计划，致力于探索新生儿测序的各个方面。他们希望将序列数据与质谱图相结合，以减少那些被误认为是得了代谢疾病的健康新生儿数量，新生儿测序有望辅助代谢疾病的筛查。

Nussbaum正在评估测序是不是能作为手段，来增强代谢疾病的筛查。他认为，目前基于测序的检测其实不能满足群体筛查项目的需求，找到在特定疾病上具有风险的个体。在理想情况下，筛查工具应当以低廉的价格提供高通量的结果，通过假阳性低的检测筛查出尽可能多的高危个体。

不过Nussbaum及其同事相信，测序有望作为2线检测，新生儿测序有望辅助代谢疾病的筛查，以便在筛查检测结果返回给医生之前减少假阳性的数量。

1般来讲，先天性代谢异常的筛查是通过串联质谱的检测来完成的。这类检测关注与脂肪酸代谢疾病相干的10几种氨基酸和酰基肉碱。虽然质谱筛查的方法已成熟，但假阳性依然是个问题，特别是对NICU的新生儿，他们由于诞生体重不足或早产而表现出代谢失衡。

研究小组推断，加入相干基因的序列信息，可能有助于增强NICU中新生儿的筛查特异性。Nussbaum指出，除有望下落终究报告给医生的假阳性数量，测序和质谱分析可同时展开，而两种类型的数据从理论上加入调剂后的筛查算法。

对NBSeq项目，研究人员计划对1600个血斑样本进行外显子组测序，这些血斑来自于儿童，但去除辨认信息，包括质谱筛查取得了假阳性还是假阴性的结果。这项遗传分析将集中在大约250个基因–其中44个在代谢疾病中发挥作用，而数百个基因通过通路分析精肯定位。

虽然最初的变异分析是在不知道个体表型的情况下进行的，但研究小组计划终究将基因分型数据与表型数据相干联。

随着测序有望作为2线筛查，研究小组也希望能够更清晰地了解那些参与代谢疾病的变异。至于研究进程中鉴定出的致病变异是否是要加入NCBI的ClinVar数据库，目前还有待肯定，由于这需要加利福尼亚公共卫生部门的许可。