Nature:相同癌症肿瘤基因变异各不相同

2017-07-24 11:06:39 来源:
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就像没有两个人有相同的基因构成,在乳腺癌病人中,也没有两个肿瘤的细胞有相同的基因组。据1项最新研究显示,不同的乳腺癌亚型也有各种各样变异的肿瘤。这1发现对乳腺癌的诊断和医治具有重要意义,有助于帮助那些发展出化疗抗性的乳腺癌病人。相干论文发表在最近出版的《自然》(Nature)杂志上。

文献来源:Clonalevolutioninbreastcancerrevealedbysinglenucleusgenomesequencing,Nature:相同癌症肿瘤基因变异各不相同.

该研究由美国德克萨斯大学遗传学系副教授尼古拉斯·纳温研究小组负责。他们开发出1种称为“核测序”的新测序方法,可对单个细胞基因组测序,这类方法与单细胞分子测序相结合,能分析数千个细胞。

事实上,不同肿瘤细胞的生长速度也大大不同。“我们发现在肿瘤生长的不同阶段,有两种截然不同的‘分子钟’在运作。”纳温说,“3阴性乳腺癌的肿瘤细胞具有增长的变异率,而雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌肿瘤细胞就不是这样。”

约75%的乳腺癌是ER+型,会随着雌激素的增加而生长,对这些病人通常是用雌激素疗法。3阴性乳腺癌在所有乳腺癌中约占15%到25%,通常对激素治疗或标准化疗没有反应。

论文第1作者、基因组学系博士后研究员王勇(YongWang,音译)表示:“单细胞基因组学领域有1个常见问题,就是没法确认单个细胞中探测到的变异。为了处理这1问题,我们结合了单细胞测序和标靶单细胞深度测序。这样不但能确认变异,还能精确检测数千个细胞的变异频率。”

而化疗中的重要问题是,肿瘤中某些细胞的变异是否是为抵抗性变异,即治疗导致的变异。“虽然这1问题在细菌中已研究了几10年,但在大部份人类癌症中还了解得很少。”纳温说,Nature:相同癌症肿瘤基因变异各不相同,“我们的数据显示,在化疗之前,肿瘤细胞中就已存在大量多样化的变异。因此我们期望,基因组多样性检测能起到预诊的作用,辨认出哪些病人可能发展出化疗抗性。”

研究人员指出,对乳腺肿瘤的大群体测序研究已辨认出许多主要的变异,但对变异的多样性还知之甚少。本研究增加了人们对肿瘤内“基因组多样性”的理解。基因组多样性在临床中很有用,可用来预测肿瘤侵袭、转移和病人生存率。

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