基因组测序跟踪检测MRSA

在医院救治的疾病中，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的感染是常见的病因,对资源不足的医院来讲，这类感染同样成为了1种巨大的负担。在资源充足的临床医治中，基因组测序已得到广泛利用，它可以用来来追踪MRSA的传播路径,但是由于控制感染的限制，传播动力学仍就是未知的。

文献来源：Genomesequencingdefinesphylogenyandspreadofmethicillin-resistantStaphylococcusaureusinahightransmissionsetting.

1项发表在GenomeResearch上的最新的研究显示,实验是在1个资源有限的医院进行的，在较高的MRSA传播率条件下，利用基因组测序法了解MRSA的传播机制。

本研究在泰国东北部的1家医院展开，为期3个月，对两个重症监护病房(ICUs)的患者进行了MRSA的监测。实验期间,46名患者和5员工最少有1次的检测结果呈阳性(16%的成年人和34%的儿童患者)。根据MRSA的遗传类似度分离菌株，排除使用传统的低分辨率的基因分类方法，基因组测序跟踪检测MRSA，这样更好的辨别了从人与人之间的菌的传播。因此,对76病人实行隔离并进行全基因组测序,对MRSA检测呈阳性的病人进行两重隔离。MRSA检测呈阳性的患者或员工没有感染的症状,除他本身就是病菌的携带者的情况。

“基于对金黄色葡萄球菌进行的全基因组测序，发现系统发育树的显著特点存在着多个不同的形态,”来自剑桥大学和威康信托基金会桑格研究所专家，SharonPeacock如是说：“这表明相同的品种的多个种病菌菌株同时存在于1间医院。”

研究单1MRSA分离株的基因组变化，使研究人员能够推断出病人间可能性最大的传播、感染途径。对ICU病房内患者们之间的MRSA传播进行视察，同时也对病人和工作人员之间的MRSA传播进行视察。与先前在英国的研究相比，本实验的结果是罕见的，前者也是研究ICU病房中MRSA病菌的传播。

“我们的长时间目标是，利用这些信息，建立感染控制预警机制,”Peacock说。“在本项研究进行的医院中，传播程度与手部卫生状态显现正相干关系。”

在实验进行的3个月期间，基因组测序结果表明，MRSA是呈动态移动的，比较普遍的是在研究的初期菌种的转移，也有1些菌种在实验后期移动。

长时间的实验进程中，对隔离后的携带MRSA的病人进行病毒的深度测序显示，虽然隔离前的所有病人携带相同菌株，但基因序列仍有1些微小的遗传差异，表明单1载体中细菌的多样性，基因组测序跟踪检测MRSA。这项研究结果也进1步支持了之前研究的观点，即研究转移路径需要控制宿主细菌的多样性，和控制传统的流行病学数据。