Nature Methods:高分辨率的测序技术

2017-06-21 01:54:29 来源:
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悉尼Garvan医学研究所的研究人员在NatureMethods杂志上发表文章展现了1种新测序技术的强大实力。文章指出,CaptureSeq(CaptureSequencing)能够大大提高基因组分析的分辨率,Nature Methods:高分辨率的测序技术,为基础研究和癌症诊断带来革命性的启示。

文献来源:QuantitativegeneprofilingoflongnoncodingRNAswithtargetedRNAsequencing.

CaptureSeq结合了基因捕获技术和深度测序,是1种靶向性的RNA测序。该技术的开发者们在这项研究中,用qRT-PCR、RNA-seq和CaptureSeq对20种人类组织的长非编码RNA进行了定量分析。研究表明,CaptureSeq在检测和定量低表达的基因时特别有优势。

之前人们以为人类基因组只含大约两万个基因,这些基因是能够转录成RNA、翻译成蛋白质的DNA片断。编码蛋白的基因只占人类基因组的2%,它们的数量和功能在动物界(从线虫到人)中相对守旧的。

后来科学家们意想到,基因组的其他部份含有不编码蛋白质的基因,这些非编码基因建立了能将人类与线虫辨别开的复杂性。在人类发育和大脑功能的各个方面,Nature Methods:高分辨率的测序技术,不编码蛋白的基因都实行侧重要的调控功能。这些基因大多只在少数细胞中表达或表达水平很低,因此很难进行研究。

CaptureSeq能够准确检测样本中多个特定基因的活性,对微量和瞬时表达的基因非常灵敏,分辨率比目前的RNA测序高很多。这类测序技术特别适合研究表达量少的非编码基因,在血癌诊断中也有很大的利用前景。

在已知某种疾病的致病基因时,我们就能够用CaptureSeq进行检测,通过基因表达情况快速确诊。举例来讲,用CaptureSeq在血癌中检测“融会基因”的出现,能够为这类疾病的诊断和治疗带来很大的帮助。

融会基因出现在20⑶0%的癌症中,而白血病大约有200个已知的融会基因。目前,医生们主要是用扩增技术来检测白血病疑似患者。但这样的技术1次只能检测1个融会基因,Nature Methods:高分辨率的测序技术,极少有患者检测了所有的白血病融会基因。用CaptureSeq同时检测这些融会基因,不但能节省时间和金钱,还可以挽救患者的生命,Nature Methods:高分辨率的测序技术。另外,CaptureSeq也能用于1系列实体瘤和许多其他的疾病。

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