传统上,研究人员都是将血液作为DNA的来源,探讨流行病学中的遗传因素。但是,这类生物样本代价昂贵,由于其收集、运输和长时间保存的难度。随着解析方法的改进,对DNA的需求数量减少了。在脸颊、细胞、尿液、粪便、唾液、嚼过的口香糖、头发和指甲中,DNA含量相对较少,引发了许多研究者的兴趣。
美国加利福尼亚大学HannahLuiPark等学者在科研出版社2015年1月英文期刊《OpenJournalofEpidemiology》(流行病学期刊)上发表了1项研究。研究中,为了使用少许人类的指甲进行基因分型的可行性实验分析,作为DNA采集来源 指甲还有待验证,需要肯定指甲中DNA和双链DNA(dsDNA)的数量和纯度,评价聚合酶链反应(PCR)的最大扩增子大小,并肯定基因分型的成功率、1致性。
从研究结果看,在许多样本中含有高浓度的单链DNA或RNA,吸光度比值显示了污染物的存在:蛋白质、酚和/或其他物资。从PCR和电泳(Electrophoresis)来看,高浓度的盐可能已阻碍了扩增反应,当扩增子大小增加到600bp时,成功率降落到79%,当大小最少为900bp时,只有50%的样品被成功扩增。学者还讨论了全基因组扩增前后的单核苷酸多态性基因分型。
平均而言,剪下的每毫克(mg)指甲里,总共可以搜集到大约90纳克(ng)的DNA,这已足够用于10多个单核苷酸多态性基因分型反应。剪下的指甲有许多的优点,包括非创伤性搜集,可以自行搜集,无需搜集工具包或研究人员的支援,作为DNA采集来源 指甲还有待验证,简单、低本钱,可以在室温条件下长时间保存。
但从指甲中提取DNA进程更艰苦,DNA易受污,会影响以后DNA的扩增和分析。虽然指甲为DNA的提取提供了又1来源,但学者视察到,相对血液或唾液中,指甲中的基因分型成功率较低。另外,由于碎片化了,指甲DNA不合适长时间的PCR扩增,因此该来源虽可行,但仍需进1步努力。
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