打开癌症生物标志物的潘多拉之盒

1月19日在《NatureGenetics》杂志发表的1项最新研究，为发现数以千计个潜伏的、新的癌症生物标志物，打开癌症生物标志物的潘多拉之盒，打开了大门。

文献来源：ThelandscapeoflongnoncodingRNAsinthehumantranscriptome.

美国密歇根大学综合癌症中心的研究人员，分析了之前没有好好研究过的1部分基因组——长非编码RNA（lncRNA）的全景图。这1很大部份的人类基因组1直被认为是暗物资，由于人们对它们知之甚少。新出现的证据表明，lncRNA可能在癌症中起作用，更好地了解它们，可为改进癌症诊断、预后或治疗，带来新的、潜伏的靶标。相干浏览：PNAS：lncRNA可作为白血病预后标志物。

本文资深作者是密歇根转化病理学中心主任、病理信息研究中心主任、癌症生物信息研究中心主任和密歇根大学医学院病理学教授ArulM.Chinnaiyan，这位高产的科学家，曾在Nature，Science，PNAS等权威学术期刊发表癌症研究论文多篇。他说：“我们了解蛋白质编码基因，但它们仅占基因组的1%到2%。而我们对非编码基因组在癌症之类的人类疾病中如何发挥作用，打开癌症生物标志物的潘多拉之盒，却了解很少。

在这项研究中，研究人员聚集了25个独立数据集、共7256个RNA测序样本，这些数据来自于公共资源，例如癌症基因组阿特拉斯项目，和来自密歇根转化病理中心的档案。他们使用高通量的RNA测序技术，在正常组织和各种常见类型癌症组织中肯定了超过58,000个lncRNA基因。

Chinnaiyan说：“我们使用所有这些数据，去解释不同组织和癌症中的基因组景观图。这打开了各种各样lncRNA的潘多拉盒子，以发掘癌症生物标志物的潜力。

”

这1完全的数据集，命名为MiTranscriptomecompendium，在1个公共网站www.mitranscriptome.org上可供科学界使用。

研究人员还发现了1个lncRNA——SChLAP1，将其肯定为侵袭性前列腺癌的1个潜伏生物标志物。与初期疾病相比，SChLAP1在转移性前列腺癌中的表达更高。SChLAP1主要存在于前列腺癌细胞中，打开癌症生物标志物的潘多拉之盒，而不在其他肿瘤细胞或正常细胞中，这为研究人员提供了希望，或许可以开发1种非入侵性的测试方法，来检测SChLAP1。这类测试方法可以用来帮助病人及其医生对初期前列腺癌做出治疗决定。

Chinnaiyan说：“1些长非编码RNA对癌症来讲常常是特定的，打开癌症生物标志物的潘多拉之盒，而蛋白质编码基因通常则不是。因此，lncRNA是开产生物标志1个非常有前程的靶标。我们希望研究人员将继续研究MiTransciptomecompendium，并开始提出lncRNA用于进1步的研究和开发。极可能只有1部份lncRNA有真实的功能，但是作为1个之前未开发的领域来讲，它具有巨大的潜力。”