快速基因测序救命于襁褓

2017-07-09 13:58:01 来源:
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得病新生儿的基因组将在24小时内测序取得,从而为临床医生提供快速诊断根据。

在只有两个月大时,这个**就已命悬1线。他全部暂短的人生是在美国密苏里州堪萨斯城儿童慈善医院新生儿重症监护室里度过的,内科医生们绞尽脑汁地寻觅导致其异常状态的病因所在。2013年4月,这名男婴的肝脏开始衰竭,医护人员告知他的父母前景不容乐观。

随后,来自儿童慈善医院的遗传学家StephenKingsmore和他的团队接手了这位病人。在3天的时间里,他们对这个男婴及其父母的基因组进行测序,并确认了1个在他和父母双方身体中共有的罕见突变。该突变被证实同1种可侵害肝脏和脾脏的过度反应免疫系统引发的疾病有关。有了这样的诊断,男婴的内科医生对症下药,以下降其免疫反应。如今,这位病人已回到家中,快速基因测序救命于襁褓,而且身体健康。

通过采取可在24小时内提供诊断的流程,Kingsmore团队已对44名生病婴儿的基因组进行了测序,上述男婴只是其中之1。在28个病例中,研究人员能够诊断出这些婴儿的状态。同时,对约1半的病例,快速基因测序救命于襁褓,他们建议在治疗方法上作出调解,快速基因测序救命于襁褓。Kingsmore最近在美国马里兰州举行的常见病基因组学会议上报告了该研究成果。10月6日,他的团队启动了1个范围更大的项目,旨在对上百名婴儿的基因组进行测序。这将成为4个新生儿测序研究中的第1个,而之前每项研究都在2013年9月接受了美国国立卫生研究院(NIH)数百万美元的资助。这些研究将解决上述流程的可行性和伦理问题,由于它很快会成为医治不明病症新生儿的通用标准。

在接下来的5年里,Kingsmore团队会对儿童慈善医院新生儿重症监护室500名生病婴儿的基因组进行测序,并将其临床疗效与利用传统基因和代谢测试诊断的另外500名同等状态婴儿作比较,快速基因测序救命于襁褓。研究人员还会评估快速测序能否让这些婴儿避免没必要要的测试和毫无用途的医治,和它能否帮助父母在孩子被诊断得不治之症时作出是不是继续治疗的决策。Kingsmore介绍说,即使有的婴儿死亡了,基因组测序和诊断也能够提供更多关于他们所携带的遗传疾病的信息。

Kingsmore把这类快速测序技术称为“工厂化”的方式,45个专家每人尽量快地操作从抽血到终究诊断流程中的其中1个步骤。研究团队从父母和孩子那里搜集DNA,以更快速确认孩子基因组中的突变,然后测序DNA并利用定制软件在病人症状的基础上“瞄准”基因组中的特定部份。在作出基于基因的诊断并将相干信息提交给婴儿的内科医生后,该团队会以匿名的方式将测序数据储存在1个安全的数据库里,以备将来研究使用。

美国杜克大学基因组学政策专家MishaAngrist表示,虽然24小时基因组测序流程使人印象深入,但目前尚不清楚对新生儿的基因测序能否很快变成通用做法。很多问题还有待解决,比如谁来为测序付费、谁可以获得相干数据和临床医生在提取同目前疾病无关的基因组信息时如何掌控好尺度。

到目前为止,只有堪萨斯城的研究团队开始相干实验,而这要得益于美国食品药品监督管理局(FDA)的豁免——同意其对病重婴儿测序。通常1项测试在被用于诊断病人前必须通过实验证明。“我想每一个人都非常希望看到这是不是会成为FDA1种新测序方法的开端,和未来它是不是会在类似的实验中出现。”Kingsmore表示。

其他由NIH资助的团队正在等待FDA或内部伦理审查委员会的审批。在波士顿,1个由波士顿儿童医院内科医生AlanBeggs和布莱根妇女医院内科医生RobertGreen领导的小组,正计划展开1项针对240名健康婴儿和240名新生儿重症监护室婴儿的研究。该团队将随机对每组婴儿中的半数进行基因组编码蛋白部份——外显子组测序,以决定仅靠这些数据能否改进婴儿的健康。

由北卡罗来纳大学教堂山分校遗传学家CynthiaPowell和JonathanBerg领导的第3个团队计划对400名得了已知遗传疾病如囊胞性纤维症的婴儿进行测序,看能否搜集到关于疾病的额外信息。由加利福尼亚大学医学遗传学家RobertNussbaum领导的团队则将测序此前在婴儿诞生时搜集的1400个血滴的外显子组,以决定这些信息能否对诊断有所帮助。

每一个团队都包括伦理学家,他们将努力解决如何保证不泄漏同诊断无关的信息等问题。“人们对基因组学信息的气力非常敏感,事实也应当如此。”Green表示,当牵涉到婴儿时这些担心又会被放大若干倍。

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