江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒

该病毒是江苏省疾控中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的1例重新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。

病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有1种新型环状单链DNA病毒片断，江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒，后根据高通量测序reads序列设计特异引物，对病人咽拭子样本进行PCR扩增，产物经过sanger测序、序列组装，江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒，于10月26日取得该病毒全长基因序列3018nt。

该病毒基因组含2种主要开放读码框（ORFs），分别编码复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap；有2个基因间隔区，江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒，其中大的间隔区含有环状病毒特点性茎环结构。与该病毒最类似的为猪粪相干的环状病毒5（porcinestool-associatedcircularvirus5(PoSCV5),isolateCP3），编码蛋白氨基酸序列类似性约为43%和50%，进化分析揭穿这2种编码蛋白分别与环状病毒科及未分类的环状单链DNA病毒聚为1类，疑似为1种新型病毒。初步将该病毒命名为HumanPoSCV5-likecircularvirus(isolateMRJ)，基因组序列已递交GenBank数据库（Accessionno.KY052047)。

对病人的尿、血和唾液样本进1步检测发现，唾液中可以检测出，而尿和血液中检测不到。猪粪相干的环状病毒可引发猪腹泻，人未见感染报导。其他种属的环状单链DNA病毒有在多发性硬化症病人的脑积液和血清、心包炎病人的心包液及脑炎病人的脑积液检测出的报导，但是与疾病的联系均不能确立。该新型环状单链DNA病毒与病例所患疾病的关联还不明确。

目前，江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒，实验室正对样本进行病毒分离培养，以便展开下1步的研究工作。该新型环状单链DNA病毒为世界首次鉴定，体现了江苏疾控中心不明缘由疾病鉴定能力的进1步提升。