Nature：科学家首次阐析人类癌症“蛋白组-基因组学”特征

由范德堡大学领导的1个研究小组鉴别出了驱动大肠癌的1些遗传突变的蛋白质“标签”。这项发表在《自然》（Nature）杂志上的重要研究，第1次综合阐析了人类癌症的“蛋白组-基因组学”（proteogenomic）特点，这将推动结直肠（大肠癌）癌诊断和治疗取得新的进展。在美国，结直肠癌是仅次于肺癌的第2大癌症死亡缘由。

文献来源：Proteogenomiccharacterizationofhumancolonandrectalcancer.

论文的资深作者是范德堡大学Ingram癌症中心JimAyers癌前病变检测和诊断研究所所长、癌症研究教授DanielLiebler博士。范德堡大学生物医学信息学副教授章冰（BingZhang）博士是这篇论文的第1作者。章冰博士早年毕业于中科院上海植物生理学研究所，主要从事肿瘤相干基因调控网络和医治靶点的研究。

“这是史无前例的1篇论文。我认为它代表了该领域1项重要的研究进展，”Liebler博士说。

蛋白质组学（Proteomics）是指在大范围水平上研究蛋白质的特点，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此取得蛋白质水平上关于疾病产生、细胞代谢等进程的整体而全面的认识。虽然已鉴别出了许多与癌症相干的遗传突变，但是对实际上完成癌症“工作”的那些蛋白质，直到现在分析它们的结构和功能都是很困难的1件事情。

研究人员利用先进的质谱技术，搜集了以往癌症基因组图谱（TheCancerGenomeAtlas）已肯定特点的95个人类大肠癌肿瘤样本的蛋白质组数据。癌症基因组图谱是1项取得联邦政府资助，旨在鉴别癌症中的遗传异常的计划。

章冰博士说：“整合这些蛋白质组数据及大量原本的基因组数据是1项艰巨的任务。但也是将这些数据转变成新见解的关键，Nature：科学家首次阐析人类癌症“蛋白组-基因组学”特征。”

DNA转录为信使RNA，再翻译成蛋白质，Nature：科学家首次阐析人类癌症“蛋白组-基因组学”特征，是1个基本的生物学原理。但是，研究人员发现样本中1些基因或乃至是RNA异常其实不1定会“翻译”成异常的蛋白质。

一样，在肿瘤样本中某些染色体片断“扩增”也并没有导致蛋白质水平扩增或上升。

Liebler说，反之，另外1些基因或染色体异常则致使了“显著的效应”，表明了蛋白质组学也许可以帮助鉴别及优先排序最“有力”的遗传变异，它们有可能成为新的诊断测试或药物治疗的靶点。

研究人员还基于蛋白质含量肯定了结直肠癌的5个亚型，其中1个具有不良的预后。蛋白质组学因此可以帮助鉴别出手术后最能够从化疗中受益的患者。

Liebler说：“我们发现的蛋白质组亚型为开发出基于蛋白质的诊断，鉴别出需要积极治疗的恶性癌症开启了大门。”