美国军队沾染性疾病医疗研究中心(USAMRIID)牵头多家知名机构,发布了病毒基因组测序的1系列标准,为从事病毒基因组测序的研究者们提供了1个通用“语言”。
USAMRIID的GustavoPalacios博士介绍道,这些标准是多家研究机构的科学家共同协作的结果,包括Broad研究所、J.CraigVenter研究所、LosAlamos国家实验室、国家过敏和感染病研究所、马里兰大学和JohnsHopkins大学。
“我们让大家坐在1起,讨论出来1个故意义的结果,这是1个重要的成绩,”他解释道。
专家们指出,基因组是生物体内的遗传物资,以DNA或RNA的情势编码。病毒基因组包括基因和1些非编码的DNA或RNA序列,含有病毒复制和传播所必须的信息。因此,肯定这些序列可以取得宝贵的信息,可以利用于各种医学和科研领域。
“多亏了高通量测序技术的飞速发展,现在几近所有的病毒研究方向都触及了测序,包括份子流行病学、药物和疫苗开发、病毒的监控与诊断等等,”Palacios说。“近来,不论是已测序的基因组还是正在投身测序的研究机构都在迅速增多。”
虽然有大量的病毒基因组正在被测序,但“目前还没有1个统1的框架,也没有通用的辞汇来描写特定病毒基因组的‘完成’程度,”USAMRIID的JasonLadner博士说。测序的完成程度,决定着基因组的下游利用,包括设计诊断产品、反向遗传系统和开发医治对策等。
研究团队希望能够通过5条标准来弥补这样的空白,这些标准涵盖了完成病毒基因组的全部阶段,使用不依赖测序技术的简单条件规定了5个种别。
“不同的测序技术可能会很快淘汰更新,因此我们这些标准没有关联任何特定的测序平台,病毒基因组测序标准发布,可以长时间的使用下去,”Ladner解释道。
研究人员指出,这些基因组测序的新标准,为所有触及病毒的研究领域提供了1个基本框架,其分类法也能够被用在公共的序列数据库中。另外,病毒基因组测序标准发布,联邦机构还可以根据这些标准,审批和调控与病毒有关的产品,例如诊断产品、疫苗和医治药物。
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