外显子组测序发现新的单基因疾病

根据《美国人类遗传学杂志》本周发表的1篇文章，CHAMP1基因上新取得的突变可能导致1种疾病，具体特点为语言障碍、智力缺点和1些罕见的脸部特点。

文献来源：DeNovoMutationsinCHAMP1CauseIntellectualDisabilitywithSevereSpeechImpairment.

德国和荷兰的研究小组对5名儿童展开了外显子组测序。这5个人没有亲属关系，但都有着严重的语言障碍、智力缺点，和罕见但类似的面部特点。将这些儿童的蛋白编码序列与其父母进行比较，研究人员发现染色体配对相干基因CHAMP1出现了新生的移码或无义突变。

作者认为，对那些症状与已知的遗传综合征堆叠，外显子组测序发现新的单基因疾病，比如Prader-Willi综合征或Angelman综合征，但相干突变检测结果为阴性的儿童，可以推敲CHAMP1检测。“我们认为，对未分类或轻度的畸形，特别是肌张力消弱和严重的语言发展缓慢，应当推敲CHAMP1检测，”他们写道。

许多新生突变都与各种情势的智力缺点和其他类型的发育缓慢有关联。在这项研究中，研究人员关注了其中1种情势，外显子组测序发现新的单基因疾病，它的特点是嘴唇和鼻子异常，并且说话困难，动作改变。

研究人员利用安捷伦的SureSelectXTHumanAllExonV5对每位患者及其父母的基因编码序列进行捕获，以后利用Illumina的HiSeq2500或ABISOLiD5500XL仪器进行测序。

通过分析，他们追踪到13号染色体CHAMP1基因中的两个移码突变和3个无义突变，外显子组测序发现新的单基因疾病。CHAMP1改变只在得了疾病的儿童中出现，外显子组测序发现新的单基因疾病，而父母的外显子组序列中没有。出人意料的是，研究人员发现两名不相干的个体有着相同的无义突变。

研究人员预测，CHAMP1基因的改变可能影响蛋白产物的锌指结构域。在细胞分裂进程中，这个蛋白通常位于有丝分裂纺锤体中，介导着丝粒与染色体分离的所需的微管相连。不过，此基因的功能丧失突变却没有出现在各大数据库中，比如dbSNP136或千人基因组计划的序列数据。

作者认为，与染色体配对相干的基因改变常常致使发育缓慢，表明CHAMP1代表了1个有吸引力的候选基因。“我们的数据进1步凸显了着丝粒和染色体配对在人类神经发育和功能中的重要性。”