Nature杂志1月2108日发表了迄今为止最全面的头颈癌基因组测序分析结果。癌症基因组图谱计划(CancerGenomeAtlas,TCGA)的科学家们揭穿了人乳头瘤病毒(HPV)和吸烟对头颈癌的影响,比较了头颈癌与其它癌症的异同,为头颈癌的诊断和医治提供了新的方向。
HPV是美国最多见的性传播病毒之1,HPV引发的头颈癌正在逐年增加。FDA批准的HPV疫苗能够预防HPV感染,但病毒感染与癌症发展之间常常存在很长的时间间隔。人们亟需理解HPV阳性头颈癌的分子改变,并在此基础上开发新的医治策略。
“我们揭露了HPV阳性和HPV阴性头颈癌之间的差异,有助于反思目前对头颈癌的处理方式。”文章的资深作者,北卡罗来纳大学的副教授D.NeilHayes说。
研究人员对279例未经医治的头颈鳞状细胞癌(HNSCC)进行了基因组分析,其中大多数样本是口腔癌(61%)和喉癌(26%),约80%的样本来自于吸烟者。
这些头颈癌样本只有25%与HPV感染有关,Nature:最全面头颈癌基因组测序结果公布。TCGA研究人员发现,Nature:最全面头颈癌基因组测序结果公布,HPV引发的肿瘤中存在FGFR3和PIK3CA基因突变,这些突变也出现在与吸烟有关的肿瘤中。EGFR(表皮生长因子受体)基因在HPV阴性肿瘤中频繁突变,但在HPV阳性肿瘤中很少出现异常。这样的信息有助于人们开发新抗癌药物和生物学指标。
研究表明,超过70%的头颈癌存在生长因子受体(EGFR,FGFR,IGFR,MET,ERBB2,DDR2)、信号份子(PIK3CA,HRAS)和细胞分裂调控(CCND1)基因的突变。这些基因在细胞生长和增殖中起到了重要作用,已成了药物开发的靶标。
研究人员还发现了头颈癌抵抗药物的新线索。在与吸烟有关的头颈癌中,癌症耐药性与FADD和BIRC2额外拷贝、CASP8基因突变或缺失有关,触及了程序性细胞死亡。在与HPV有关的癌症中,癌症抗性与TRAF3基因缺失、E2F1基因额外拷贝有关。
这项研究将头颈癌与其它癌症进行了比较,揭露了癌症发展的通用路径,Nature:最全面头颈癌基因组测序结果公布,发现了潜伏的医治机会。“头颈癌的基因组与肺鳞状细胞癌和宫颈癌很类似,这让我们很意外。这些癌症构成于不同的器官,但在遗传学上却很类似,”Dr.Hayes说,Nature:最全面头颈癌基因组测序结果公布。这些类似的遗传学异常,产生在帮助细胞应对侵害和压力的通路中。
这项大范围癌症分析有助于建立各种头颈癌的基因组图谱,为未来的头颈癌研究和医治提供了重要的新线索。
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