Sanger研究院等处的研究人员发布了第1个分析罕见发育疾病遗传成因的全国性项目,通过这1项目,Nature发布重大成果:检测疾病的12大新致病基因,研究人员发现了12种之前从未发现过的致病基因。
“解密发育疾病项目”(DecipheringDevelopmentalDisorders,DDD)是迄今为止全球最大范围,全国性范围的全基因组诊断测序项目,通过对上千名儿童基因组DNA的测序,并将其与临床特点进行比较,发现多种疾病,比如智力障碍,先天性心脏疾病等的遗传因素。
DDD项目由英国国民保健服务NHS和Sanger研究院合作,并由卫生署和WellcomeTrust(健康创新挑战基金)资助,研究成员由来自24个地区,180位临床医师组成,他们分析了1133位得了严重疾病儿童的超过20,000个基因,这些孩子得的疾病很罕见,采取标准的临床检测方法没法初期诊断。
这1项目搜集临床信息和基因组遗传突变,如果具有类似症状的患者会出现共同的突变,那么这就可以帮助我们缩小基因组中致病突变的搜索范围。但是这其实不容易,由于某种特殊突变出现的概率很小,小到只有5000万分之1。DDD项目就是希望能通过全国范围内的数据共享网络,找到这些可能出现的罕见失序。而此次发现的12个新基因中就有4个基因是在两个,或更多个非亲缘关系,相隔几百英里的儿童身上发现。
这样就可以令科学家们以最快的速度找到新病发例的致病缘由,Nature发布重大成果:检测疾病的12大新致病基因。比如说两个没有亲缘关系的儿童,都产生了PCGF2相同突变,这类基因在胚胎发育进程中扮演了重要角色,研究人员发现他们具有惊人类似的症状和脸部特点。这就是1种新型畸形综合征的发现。
此次所有新发现的发育障碍都是由新基因,原初基因酿成的,也就是说,这些基因在儿童的父母身上并没有发现,只有儿童本身才有。DDD项目指出,利用未出现发育疾病的父母的遗传数据,分析挑选出良性遗传变异,和找到自己孩子的致病缘由,这很重要。
“DDD项目表明100,000个基因测序将能产生许多有用的数据,真正帮助到遗传学研究人员,和临床诊断和医治,”GenomicsEngland首席科学家MarkCaulfield教授说。
DDD项目开始于2010年,终究将分析12000个家庭。到目前为止研究人员已完成10%的任务,发现了12种发育障碍的新型遗传缘由,增加了10%临床诊断的机会。
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