在HIV诊治中,即时检测是非常重要的,对婴儿来讲更是如此。有案例显示,HIV感染后立刻进行医治就可以控制住患者体内的病毒,让它们没法进行复制。举例来讲,生来就携带HIV的密西西比婴儿,在诞生后立即得到了医治。后来这个孩子停药了两年多,病毒复制仍然得到了控制。
目前婴儿HIV诊断的金标方法是DNAPCR,但许多地区其实不具有这样的条件。在这类条件下,RPA技术正好可以大展身手。
纸做的HIVDNA检测装置
2012年9月,研究人员开发了1个由纸、玻璃纤维和塑料制成的装置,用来对HIV的DNA进行RPA扩增。这个装置本钱低、小巧轻便、而且易于使用,只需5步就能够弄定HIV检测。扩增结果可以通过侧流层析试纸来读取。
人们可以先从婴儿的干血斑样本中提取DNA,然后再进行RPA扩增。研究显示,用这个装置进行RPA扩增反应,能在105分钟内将10拷贝的HIVDNA扩增到可检出的水平。可见,这是1个前景广阔的低本钱即时检测装置。
RPA检测HIVDNA的实战效果
如果不能及时检测婴儿体内的HIV⑴,就会延误医治并影响治疗效果。2013年的1项研究设计了靶标HIV⑴基因组不同区域(长末端重复LTR和pol)的两种探针。研究人员用这两个探针分别进行RPA扩增,然落后行荧光检测和侧流层析试纸检测。研究表明,在HIV检测中大展身手的RPA,这样的方法能够可靠地检测到3拷贝的前病毒DNA。研究人员在此基础上测试了多个HIV⑴突变株,pol和LTR引物的扩增率分别为98.6%和93%。
这是1个能检测出HIV⑴所有主要亚型的等温扩增法,能够在资源匮乏的地区帮助人们诊断携带被HIV感染的婴儿。
文献来源:RapiddetectionofHIV⑴proviralDNAforearlyinfantdiagnosisusingrecombinasepolymeraseamplification.
HIVDNA的实时定量检测
今年5月,研究人员使用内参和标准曲线,通过RPA扩增定量了HIV⑴DNA的浓度。这是1种基于实时荧光数据的定量RPA技术,被称为qRPA,在HIV检测中大展身手的RPA。
这项研究通过1系列实验,分析和定量了不同浓度的HIV⑴DNA样本。研究显示,在所有测试的浓度范围内,qRPA的预测值与正确值在1个数量级以内。可见,定量RPA(TwistAmpexo)可以作为核酸定量的有力工具,用于即时检测和体外诊断。
文献来源:QuantificationofHIV⑴DNAusingReal-TimeRecombinasePolymeraseAmplification,AnalyticalChemistry
不插电的HIVDNA检测
绝大多数核酸扩增(包括等温扩增)都需要电,在HIV检测中大展身手的RPA。但在资源匮乏的区域,比较好是有不需要延续供电的诊断工具。RPA的工作温度在25⑷3°C之间,不需要严格控制孵育温度,就能够到达理想的性能。
今年9月的1项研究显示,当室温在31°C-43°C之间时,孵育20分钟RPA反应就可以成功进行,检测到10拷贝的HIV⑴前病毒DNA。
当室温降到30°C以下时,RPA的扩增性能有所降落。为此,在HIV检测中大展身手的RPA,研究人员开发了1个简单的化学加热器,在室温10⑶0°C时孵育HIV⑴RPA反应。研究显示,RPA的性能通过加热孵育得到了恢复,能检测到10拷贝的HIV⑴前病毒DNA。
研究人员在15°C、20°C、25°C和30°C,用这类加热器进行了12个RPA反应,结果全部扩增成功。他们还发现,当温度较低时,孵育30分钟能增进RPA的扩增性能。研究表明,对RPAHIV⑴反应进行化学加热,与电力设备效果差不多。这也说明,RPAHIV⑴检测不需要多好的设备,就可以够实现高灵敏度的诊断。
文献来源:Non-InstrumentedIncubationofaRecombinasePolymeraseAmplificationAssayfortheRapidandSensitiveDetectionofProviralHIV⑴DNA.
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