Cancer Cell：隐藏在“垃圾DNA”中的癌基因

科学家们1直致力于在基因组中寻觅与癌症有关的遗传学改变。在此基础上，人们对癌症的理解和癌症医治都获得了巨大的进展。

文献来源：AFunctionalGenomicApproachIdentifiesFAL1asanOncogenicLongNoncodingRNAthatAssociateswithBMI1andRepressesp21ExpressioninCancer.

这类研究大多关注基因组的编码区域，但这1区域只占到人类DNA的2%，应当还有大量癌症相干突变产生在非编码DNA上。非编码DNA曾被称为“垃圾DNA”，虽然人们早已知道它们其实其实不是垃圾（许多转录为RNA），但解析这些序列的功能其实不容易。

日前宾夕法尼亚大学的副教授LinZhang领导研究团队发现，1个非编码RNA的表达与卵巢癌有关，这1成果发表在本周的CancerCell杂志上。

研究人员在卵巢癌、乳腺癌等12种癌症中，建立了将近14，Cancer Cell：隐藏在“垃圾DNA”中的癌基因,000个长非编码RNA（lncRNA）的DNA拷贝数图谱。卵巢癌和乳腺癌是两个主要的BRCA相干癌症。随后，他们以临床、遗传学和基因表达数据为基础进行过滤，剔除与癌症无关的拷贝数改变，系统地研究了剩下的37个lncRNA。

研究显示，1号染色体上的FAL1（focallyamplifiedlncRNA）就是1个RNA癌基因。迄今为止，只有少数lncRNA与癌症关联起来。研究人员给免疫功能低下的小鼠引入人类卵巢肿瘤，然后注入siRNA对FAL1进行RNA干扰，这1措施成功使肿瘤出现了萎缩。

个性化诊断

FAL1在卵巢癌和乳腺癌中存在过表达，通过RNAi阻断该基因的活性，能减少癌细胞的生长。另外一方面，这个基因的过表达会促进细胞的生长。研究人员在人卵巢癌样本中进行分析，发现FAL1的高表达与预后差有关。

“这是首次在全基因组范围内，通过生物信息学和临床信息系统性地鉴定lncRNA，”Zhang说。

为了鉴定FAL1的功能，研究人员找到了与FAL1RNA有关的蛋白BMI1。BMI1是基因调控复合体PRC1中的1员，能下调数百个基因的表达，其中就包括编码肿瘤抑制蛋白p21的基因。研究显示，FAL1缺失会使BMI1蛋白变得不稳定。

研究指出，Cancer Cell：隐藏在“垃圾DNA”中的癌基因，卵巢癌中的FAL1扩增使FAL1RNA过量，增强了BMI1蛋白的稳定性，下调了p21，并终究致使细胞生长脱离控制。FAL1的表达可以作为生物学指标，帮助人们预测BRCA相干癌症的预后情况。另外，人们也能够开发小份子药物，特异性靶标FAL1RNA或阻断FAL1-BMI1相互作用，对相干癌症进行医治。