两篇柳叶刀子刊:疟疾治疗的耐药性与拷贝数变异相关

2017-04-21 14:15:50 来源:
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每一年约有2亿人感染疟疾,导致50万人死亡。在东南亚,疟疾的1线治疗方案通常是青蒿素和哌喹联合医治。但是,7年前开始出现了青蒿素耐药性,最近导致疟疾的镰状疟原虫(Plasmodiumfalciparum)也开始对哌喹耐药。

文献来源:Asurrogatemarkerofpiperaquine-resistantPlasmodiumfalciparummalaria:aphenotype-genotypeassociationstudy.

Geneticmarkersassociatedwithdihydroartemisinin-piperaquinefailureinPlasmodiumfalciparummalariainCambodia:agenotype-phenotypeassociationstudy.

两个独立的研究小组,1个来自柬埔寨的巴斯德研究院,另外一个来自美国国立卫生研究院(NIH)和威康信托基金会桑格研究中心,两篇柳叶刀子刊:疟疾治疗的耐药性与拷贝数变异相关,分别对散布于柬埔寨的镰状疟原虫(P.falciparum)的哌喹耐药性的遗传关联性进行了分析。两个研究小组的结果都表明,plasmepsin2和plasmepsin3基因的拷贝数增加可作为耐药性标志物。这两项研究近日发表在《TheLancetInfectiousDiseases》上,两篇柳叶刀子刊:疟疾治疗的耐药性与拷贝数变异相关。

plasmepsin2和plasmepsin3拷贝数增加可作为哌喹耐药性的标志物

在1篇文章中,巴斯德研究院的DidierMénard带领研究人员对31个具有青蒿素耐药性的柬埔寨镰状疟原虫(P.falciparum)进行外显子组测序,寻觅与哌喹敏感性或耐药性相干的SNPs和CNVs,哌喹的敏感性和耐药性是根据哌喹生存分析曲线(PSA)判断的。研究人员终究发现了两个SNP与药物敏感性或耐药性相干,但是他们认为这些位点不够明确。

另外,他们将14号染色体上的1个拷贝数变异与哌喹耐药性关联了起来,这个区域称作plasmepsin,包括两种血红蛋白消化蛋白。研究人员视察到,不论耐药性和敏感性的状态,plasmepsin2基因的序列是野生型的,plasmepsin3基因的序列包括已知的多态性。这些基因的拷贝数与体外PSA存活率之间存在显著关联。

研究人员在1组725名疟疾患者接受青蒿素和哌喹治疗前,搜集了样本并随访6周。对这组研究对象来讲,plasmepsin2拷贝数可以预测治疗失败,灵敏度到达94%,特异性到达77%。同时,plasmepsin2多拷贝与医治失败相干,校正风险比为20.4,这表示,与没有该基因多拷贝的患者相比,具有该基因多拷贝的患者治疗失败的风险更高。

Ménard等作者的结论是,plasmepsin2可以作为哌喹耐药性的份子标志物。

另外一篇文章中,NIH的RickFairhurst领导的研究人员对从柬埔寨3个省的患者中分离得到的297个镰状疟原虫(P.falciparum)进行全基因组关联分析。他们研究了11,630个SNPs和43个CNVs是不是与体外哌喹半数抑制浓度(IC50,用药效果为1半时所需的药物浓度)和医治失败相干。

他们的分析一样说明,plasmepsin2和plasmepsin3的扩增与哌喹耐药性相干。

Fairhurst等人利用1组133个样本的63天的临床结果数据发现,两篇柳叶刀子刊:疟疾治疗的耐药性与拷贝数变异相关,plasmepsin2和plasmepsin3基因扩增在那些疟疾复发和治疗效果下落的患者中丰度非常高。出现plasmepsin2和plasmepsin3基因扩增的患者治疗成功率为41%,而缺少这些基因扩增的患者的医治成功率为95%。另外,研究人员还发现1个SNP(exo-E415G)与哌喹耐药性和治疗失败相干。

两组研究人员都认为,plasmepsin2和plasmepsin3拷贝数可以作为哌喹耐药性的标志物。巴斯德研究院的Ménard说,“若开发1个遗传试剂盒,两篇柳叶刀子刊:疟疾治疗的耐药性与拷贝数变异相关,将这些新的标志物和青蒿素及甲氟喹耐药性的标志物结合起来,可用来追踪耐药性的分散,并提供及时的遏制策略信息。”

另外,这些标志物还可以帮助调查人员研究该地区耐药性的传播范围,理解寄生虫的生物学机制和推荐替换疗法。

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